MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori ELS37 chromosome

Total Repeats: 30237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017063	TGAG	2	8	27	34	25 %	25 %	50 %	0 %	383749064
2	NC_017063	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749064
3	NC_017063	TTCT	2	8	259	266	0 %	75 %	0 %	25 %	383749064
4	NC_017063	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749064
5	NC_017063	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	383749064
6	NC_017063	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	383749064
7	NC_017063	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749064
8	NC_017063	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383749064
9	NC_017063	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	383749064
10	NC_017063	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383749065
11	NC_017063	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	383749065
12	NC_017063	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383749065
13	NC_017063	CT	3	6	691	696	0 %	50 %	0 %	50 %	383749065
14	NC_017063	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749065
15	NC_017063	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	383749065
16	NC_017063	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749065
17	NC_017063	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	383749066
18	NC_017063	TCA	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749066
19	NC_017063	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383749066
20	NC_017063	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383749066
21	NC_017063	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383749066
22	NC_017063	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	383749066
23	NC_017063	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	383749066
24	NC_017063	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	383749066
25	NC_017063	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	383749066
26	NC_017063	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383749066
27	NC_017063	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	383749066
28	NC_017063	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	383749066
29	NC_017063	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749066
30	NC_017063	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749066
31	NC_017063	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	383749067
32	NC_017063	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	383749067
33	NC_017063	TGA	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749067
34	NC_017063	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	383749067
35	NC_017063	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	383749067
36	NC_017063	GAA	3	9	2877	2885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383749067
37	NC_017063	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	383749067
38	NC_017063	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383749067
39	NC_017063	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383749067
40	NC_017063	AAG	2	6	3094	3099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383749067
41	NC_017063	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383749067
42	NC_017063	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383749067
43	NC_017063	AG	3	6	3228	3233	50 %	0 %	50 %	0 %	383749068
44	NC_017063	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	383749068
45	NC_017063	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	383749068
46	NC_017063	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	383749068
47	NC_017063	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749068
48	NC_017063	CTA	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749068
49	NC_017063	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749068
50	NC_017063	ACA	2	6	3774	3779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383749068
51	NC_017063	ATAG	2	8	3834	3841	50 %	25 %	25 %	0 %	383749068
52	NC_017063	A	7	7	3866	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	383749068
53	NC_017063	TGT	2	6	3918	3923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749068
54	NC_017063	TGG	2	6	3976	3981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383749068
55	NC_017063	TGC	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383749069
56	NC_017063	TCGC	2	8	5423	5430	0 %	25 %	25 %	50 %	383749069
57	NC_017063	ATTC	2	8	5452	5459	25 %	50 %	0 %	25 %	383749069
58	NC_017063	CATT	2	8	5496	5503	25 %	50 %	0 %	25 %	383749069
59	NC_017063	ATT	2	6	5518	5523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383749069
60	NC_017063	TGG	2	6	5616	5621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383749069
61	NC_017063	TGA	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749069
62	NC_017063	A	6	6	5728	5733	100 %	0 %	0 %	0 %	383749069
63	NC_017063	TCT	2	6	5755	5760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749069
64	NC_017063	T	6	6	5760	5765	0 %	100 %	0 %	0 %	383749069
65	NC_017063	A	6	6	5770	5775	100 %	0 %	0 %	0 %	383749069
66	NC_017063	GTT	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749069
67	NC_017063	TAA	2	6	5887	5892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383749069
68	NC_017063	TTA	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383749069
69	NC_017063	GTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383749069
70	NC_017063	GTT	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749069
71	NC_017063	GTGC	2	8	6074	6081	0 %	25 %	50 %	25 %	383749069
72	NC_017063	GTT	2	6	6190	6195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749069
73	NC_017063	CAT	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749069
74	NC_017063	T	6	6	6286	6291	0 %	100 %	0 %	0 %	383749069
75	NC_017063	GCTTGC	2	12	6320	6331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383749069
76	NC_017063	CAG	2	6	6366	6371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383749069
77	NC_017063	TCA	2	6	6560	6565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749069
78	NC_017063	TGT	2	6	6675	6680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749069
79	NC_017063	TAC	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749069
80	NC_017063	GCTA	2	8	6691	6698	25 %	25 %	25 %	25 %	383749069
81	NC_017063	ATT	2	6	6703	6708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383749069
82	NC_017063	CTA	2	6	6710	6715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749069
83	NC_017063	CAC	2	6	6738	6743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383749069
84	NC_017063	CAG	2	6	6753	6758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383749069
85	NC_017063	TTTG	2	8	6759	6766	0 %	75 %	25 %	0 %	383749069
86	NC_017063	GTAGGT	2	12	6772	6783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383749069
87	NC_017063	CTT	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749069
88	NC_017063	TTG	2	6	6844	6849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749069
89	NC_017063	TGGT	2	8	6958	6965	0 %	50 %	50 %	0 %	383749069
90	NC_017063	AAC	2	6	6973	6978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383749069
91	NC_017063	TGCCAT	2	12	6999	7010	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383749069
92	NC_017063	CCG	2	6	7053	7058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383749069
93	NC_017063	T	6	6	7101	7106	0 %	100 %	0 %	0 %	383749069
94	NC_017063	ATCG	2	8	7141	7148	25 %	25 %	25 %	25 %	383749069
95	NC_017063	GCT	2	6	7168	7173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383749069
96	NC_017063	CGTT	2	8	7176	7183	0 %	50 %	25 %	25 %	383749069
97	NC_017063	GTT	2	6	7198	7203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749069
98	NC_017063	CAT	2	6	7705	7710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749070
99	NC_017063	GCC	2	6	7711	7716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383749070
100	NC_017063	TCT	2	6	7772	7777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749070
101	NC_017063	GAAACC	2	12	7820	7831	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383749070
102	NC_017063	AAT	2	6	7870	7875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383749070
103	NC_017063	CTT	2	6	7878	7883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749070
104	NC_017063	TTCA	2	8	7948	7955	25 %	50 %	0 %	25 %	383749070
105	NC_017063	CCA	2	6	7964	7969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383749070
106	NC_017063	GC	3	6	8015	8020	0 %	0 %	50 %	50 %	383749070
107	NC_017063	ATG	2	6	8021	8026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749070
108	NC_017063	TCA	2	6	8045	8050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749070
109	NC_017063	CG	3	6	8080	8085	0 %	0 %	50 %	50 %	383749070
110	NC_017063	CCG	2	6	8099	8104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383749070
111	NC_017063	CTT	2	6	8118	8123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749070
112	NC_017063	TCA	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749070
113	NC_017063	T	6	6	8167	8172	0 %	100 %	0 %	0 %	383749070
114	NC_017063	CACTT	2	10	8185	8194	20 %	40 %	0 %	40 %	383749070
115	NC_017063	AG	3	6	8227	8232	50 %	0 %	50 %	0 %	383749070
116	NC_017063	TCTT	2	8	8242	8249	0 %	75 %	0 %	25 %	383749070
117	NC_017063	TTTGA	2	10	8296	8305	20 %	60 %	20 %	0 %	383749070
118	NC_017063	CAT	2	6	8322	8327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749070
119	NC_017063	GTG	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383749070
120	NC_017063	TTC	2	6	8434	8439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749070
121	NC_017063	CCG	2	6	8453	8458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383749070
122	NC_017063	TTTCT	2	10	8484	8493	0 %	80 %	0 %	20 %	383749070
123	NC_017063	CAC	2	6	8554	8559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383749070
124	NC_017063	GAT	2	6	8596	8601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749070
125	NC_017063	T	6	6	8628	8633	0 %	100 %	0 %	0 %	383749070
126	NC_017063	GGA	2	6	8643	8648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383749070
127	NC_017063	T	7	7	8667	8673	0 %	100 %	0 %	0 %	383749070
128	NC_017063	GA	3	6	8744	8749	50 %	0 %	50 %	0 %	383749070
129	NC_017063	TCT	2	6	8918	8923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749070
130	NC_017063	T	6	6	8935	8940	0 %	100 %	0 %	0 %	383749070
131	NC_017063	T	6	6	8947	8952	0 %	100 %	0 %	0 %	383749070
132	NC_017063	CTT	2	6	9039	9044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749070
133	NC_017063	GGT	2	6	9073	9078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383749070
134	NC_017063	GCA	2	6	9092	9097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383749070
135	NC_017063	CTT	2	6	9117	9122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749070
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137	NC_017063	T	6	6	9364	9369	0 %	100 %	0 %	0 %	383749071
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